生物信息学题库

[多选题] RFLP是DNA多态性中最多见的一种，它产生的机制包括（）A . DNA分子产生突变，使某些酶切位点数增加B . DNA分子产生突变，使某些酶切位点数减少C . 限制性酶切位点之间重复序列数目变异D . 限制性酶星活性E . 限制性酶切位点前后的DNA片断发生插入或删除

[名词解释] Orthologs（直系同源）

[名词解释] Xenologs（异同源）

[问答题] 简述生物类的数据库类别分为有哪两种及其定义

[问答题] 什么是smallRNA测序？

[问答题] 简述在蛋白质三级结构预测中同源建模法的步骤。

[名词解释] 系统发生树（Phylogenetic tree）

[问答题] 什么是高通量测序？

[问答题] 什么是Chip-seq？

[问答题] 什么是Sanger法测序（一代测序）？

[名词解释] 无根树（unrooted tree）

[问答题] 什么是miRNA测序？

[名词解释] 功能基因组学

[问答题] 简述KEGG的PATHWAYS数据库中包括的哪6种数据库？

[多选题] 下面序列哪些为反向重复序列（）A . …GCACTTG…GCACTTG…B . …GCACTTGCAAGTGC…；…CGTGAAC…CGTGAAC…；…CGTGAACGTTCACG…C . …GCACTTG…CAAGTGC…D . …GCACTAGCTAGCGG…；…CGT

[名词解释] 折叠识别法

[多选题] 分析EST序列时首要注意以下几点（）A . EST序列中除了AGTC外，可能出现未知碱基B . EST只是单次测序，得出的结果没有可信度C . EST序列中可能出现错误的插入和缺失，导致读码框移位D . 某个EST序列是数据库中另一序列的一个片段E . 某个EST序列不在基因的编码区内

[名词解释] 距离法

[填空题] 序列比对的基本思想，是找出（）和（）的相似性，就是通过在序列中插入（）的方法使所比较的序列长度达到一致。比对的数学模型大体分为两类，分别是（）和（）。

[问答题] 简述常用的引物设计软件的名称和各自特点。

[问答题] 什么是de novo测序？

[名词解释] Homology（同源）

[问答题] 什么是RIP-seq？

[问答题] 什么是基因组重测序（GenomeRe-sequencing）？

[名词解释] Paralogs（旁系（并系）同源）

[问答题] 什么是外显子测序（whole exon sequencing）？

[名词解释] 整体联配

[名词解释] 互补序列

[名词解释] 最佳联配

[问答题] PCR引物设计有哪些原则？